Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4BQ07343 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4BQ07343 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms