Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EGR3Q06889 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR3Q06889 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms