Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC9Q06265 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms