Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms