Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms