Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF8Q02556 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms