Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms