Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POU5F1Q01860 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms