Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC10Q01780 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms