Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCCQ00597 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms