Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms