Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms