Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR1P84550 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms