Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD3P84022 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms