Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms