Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms