Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms