Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5BP61020 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5BP61020 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms