Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01547P58512 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms