Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EEFSECP57772 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms