Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMDP57764 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms