Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFRA1P56159 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms