Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFDNP55196 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFDNP55196 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFDNP55196 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFDNP55196 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFDNP55196 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AFDNP55196 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms