Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHB4P54760 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms