Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms