Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms