Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMTNP53814 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMTNP53814 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNP53814 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNP53814 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNP53814 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNP53814 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMTNP53814 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMTNP53814 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMTNP53814 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms