Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC3P51654 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC3P51654 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC3P51654 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC3P51654 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms