Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE6CP51160 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms