Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms