Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK7P50613 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK7P50613 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK7P50613 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK7P50613 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK7P50613 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK7P50613 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms