Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN2P49810 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms