Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPIAP49247 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPIAP49247 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPIAP49247 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPIAP49247 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPIAP49247 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPIAP49247 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms