Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLMP48507 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCLMP48507 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms