Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
IQGAP1P46940 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IQGAP1P46940 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms