Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP5P45974 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP5P45974 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP5P45974 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP5P45974 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP5P45974 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP5P45974 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP5P45974 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP5P45974 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms