Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACADSBP45954 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms