Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MAGEA1P43355 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms