Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC5P40937 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC5P40937 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC5P40937 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC5P40937 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC5P40937 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC5P40937 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC5P40937 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC5P40937 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC5P40937 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC5P40937 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC5P40937 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms