Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4A3P38919 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4A3P38919 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms