Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THBS4P35443 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms