Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NF2P35240 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NF2P35240 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NF2P35240 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NF2P35240 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NF2P35240 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NF2P35240 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NF2P35240 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NF2P35240 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NF2P35240 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NF2P35240 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NF2P35240 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NF2P35240 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NF2P35240 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NF2P35240 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NF2P35240 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms