Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP2C19P33261 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP2C19P33261 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms