Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD11P31277 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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