Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms