Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA13P31271 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA13P31271 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms