Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms