Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTGFP29279 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTGFP29279 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTGFP29279 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTGFP29279 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTGFP29279 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTGFP29279 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTGFP29279 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms