Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRMP28827 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
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