Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms